台湾卸任和接任政府交接工作的冲突22日深夜浮上台面，民进党发函给总统府表示，民进党的政权交接小组，已经直接和相关部会的人员联系，就新政权关切的议题，要求对方提供相关数据，并安排说明。
由于目前蔡英文还没有正式就职，还不是正式的总统，总统府深夜发出新闻稿响应，暗示目前政府各部会如果没有取得行政院的授权，不会办理交接，也不会有说明。
不过马政府显然不接受民进党这套逻辑。总统府首先反击，说并不反对交接工作法制化，但民进党正在推动的交接条例，部分内容可能违宪，强调立法内容不能抵触宪法。
总统府并指出，十九日双方政权交接小组第一次开会的结论是，「由接任政府交接小组针对交接作业实施要项，尽速提供修正意见，以便定案」。这话等于是告诉所有政府部会，必须在行政院授权之后才能办理交接，也才能提供数据、做简报，台湾新旧任政府在交接工作上显然已经卯上了。
