日本外相茂木敏充星期五（11月27日）在记者会上表示，王毅的言论是“完全不可接受的”。茂木敏充明确表示，尖阁诸岛毫无疑问“是我国固有领土，目前有效控制着，根本不存在应解决的主权问题。” 他就王毅的主权主张重申“基于中国自身立场，完全无法接受”。
王毅11月24日和25日对日本进行两天访问。尖阁诸岛主权是王毅此次访问行程，日中高层会谈的重要议题之一。尖阁主权是妨碍两国关系的主要因素，日中都宣称对尖阁诸岛拥有主权。
王毅访日期间不止一次表明中国对尖阁诸岛（钓鱼岛）拥有主权的立场。
日本共同社报道，日本首相菅义伟11月25日与王毅会谈之后，王对媒体表示，希望采取措施使领土问题不会影响日中两国的发展。
王毅在东京某宾馆接受记者采访，就围绕尖阁诸岛（中国称钓鱼岛）的日中对立提出建议称，如果相互采取公务船以外船只不进入周边海域的措施，事态应该会得到改善。
除了日本外相对王毅主权言论表态驳斥之外，日本内阁官房长官加藤胜信11月26日表示，王毅的主权言论完全出于中国的单方面立场，日本政府不会接受。
不过，日本外相和内阁官房长官的上述表态并不被日本政界一些人士接受，他们认为日本官方对王毅的言论反应迟缓且缺乏力度。
共同社报道，针对王毅在24日的日中外长会谈后举行的联合记者会上有关尖阁主权的言论，日本自民党议员山田宏追究称：“国民强烈希望茂木外相强硬反驳。为什么当时没有反驳？”
日本外务省一名官员周四似乎解释了茂木外相没有当场反驳王毅言论的原因。这位官员表示，礼仪规定，联合记者会上每位部长只有一次发言机会，茂木敏充第一个发言。
