4月5日，北京表示，疫情防控形势依然严峻复杂，很有可能较长时期处于疫情防控状态。北京也仍在继续执行返京人员居家或集中隔离14天的规定。截至4月4日24时，北京已经累计报告境外输入确诊病例170例，尚无境外输入无症状感染者报告。
北京通报，两例确诊病例在集中隔离期出现症状却未报告，造成疫情传播隐患。其中一例是4月3日新增的确诊病例，这位美国留学生在2月29日从美国底特律飞往荷兰鹿特丹，随后又赴英国伦敦。在伦敦，她和同行的老师、同学共16人停留8天，参观多个地方。3月17日启程返回国内，19日抵达北京，在集中隔离点观察。
1个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例39例，其中38例为境外输入病例，1例为本土病例（广东1例）；新增死亡病例1例（湖北1例）；新增疑似病例10例，均为境外输入病例。
据国家卫健委网站消息，当日新增治愈出院病例114例，解除医学观察的密切接触者2151人，重症病例减少30例。 境外输入现有确诊病例693例（含重症病例22例），现有疑似病例88例。累计确诊病例951例，累计治愈出院病例258例，累计死亡病例0例。
截至4月5日24时，据31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告，现有确诊病例1299例（其中重症病例265例），累计治愈出院病例77078例，累计死亡病例3331例（湖北核增1例），累计报告确诊病例81708例，现有疑似病例88例。累计追踪到密切接触者713988人，尚在医学观察的密切接触者16154人。
湖北新增确诊病例0例（武汉0例），新增治愈出院病例69例（武汉69例），新增死亡病例1例（武汉1例），现有确诊病例577例（武汉574例），其中重症病例234例（武汉231例）。累计治愈出院病例64014例（武汉46863例），累计死亡病例3212例（武汉2571例，孝感核增1例），累计确诊病例67803例（武汉50008例）。新增疑似病例0例（武汉0例），现有疑似病例0例（武汉0例）。
31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增无症状感染者78例，其中境外输入无症状感染者40例；当日转为确诊病例5例（境外输入5例）；当日解除医学观察50例（境外输入4例）。尚在医学观察无症状感染者1047例（境外输入275例）。
累计收到港澳台地区通报确诊病例1297例：香港特别行政区890例（出院206例，死亡4例），澳门特别行政区44例（出院10例），台湾地区363例（出院54例，死亡5例）。
