本周一，陈日君通过博客表示，正在进行中的梵蒂冈教廷与北京当局的谈判堪称“灾祸”，会让中国大陆的教友承受苦痛。这也是香港荣休主教连日来又一次抨击梵蒂冈天主教庭与中国的谈判。
陈日君在其2月5日发布的博客中指出，忠于罗马教廷的中国大陆地下教会的信徒“固执不听话的大概会被拘捕了”。这是因为“中国政府会严厉执行执行宗教规则”，“大灾祸也已开始”。
连日来，陈日君一直在抨击梵蒂冈教廷试图与北京当局改善关系、实现双边关系的历史性突破。2009年荣休的陈日君在一月的一篇博客文章中披露，教廷要求两名中国地下教会的主教让位于北京当局任命的主教人选。而在周一的博客文章中，陈日君更是认为教廷的行为是在出卖大陆的信徒。“大陆的兄弟们不怕倾家荡产、不怕铁窗风味，也不怕倾流鲜血。他们最大的痛苦是被’亲人’负责。”
据估计，中国大陆大约有1200万名天主教徒，其中大约有一半只认同梵蒂冈教廷，还有一半则隶属于中国官方许可的天主教爱国会。梵蒂冈指示地下教会主教让位于北京官方人选，被外界认为是教廷试图与北京改善关系的一项举措。
陈日君多年来一直对北京当局持批评态度。他在周一的博客文章中写道：“大陆的兄弟姊妹这几天听到了梵蒂冈准备向中共屈服了，心里大概很不舒服。见非法，绝罚的主教都将被合法化了，而合法的反被逼退下了，那末地下的合法的主教们，不都会为他们的命运担忧吗？神父，教友们想想不久就要服从及尊敬那些今天是非法，绝罚的，明天因政府撑腰而获教廷认为合法的主教，会有多少苦痛的长夜？”他还说：“只要我肯定讲的是公道的话，有益的话，那末凭我的年龄已不怕什么得失了。我之所以还想多嘴，是因为我怕很快我再不能讲话了。请大家容忍我。”
