在欧盟决定大规模安置难民之後，外界担心是否会有恐怖分子混在其中，藉机进入欧洲发动恐怖攻击。不过，欧盟反恐行动官员分析不太可能。
尽管出於人道立场，欧盟决定收容数量庞大的难民，但随着来自叙利亚丶利比亚等地的难民人数增加，欧洲境内对於是否会有伊斯兰国（IS）恐怖分子或其他恐怖组织成员，趁乱混进欧洲境内发动恐怖攻击行动的担忧也逐渐增加。
欧盟反恐行动负责人戴科乔夫（Gilles de Kerchove）向「欧洲动态」（EurActiv）表示，难民危机是欧盟现在面对的大挑战，但若是将难民与恐怖主义混为一谈，那完全是逻辑错误。
戴科乔夫指出，中东恐怖组织根本不需要透过难民庇护途径将恐怖分子送进欧洲，许多欧洲出身的当地人就算不曾出国，也能透过网路被恐怖组织吸收，或是透过旗下发行的杂志对这些欧洲人洗脑，甚至在杂志中列出建议攻击目标，让这些被吸收的欧洲人得以在欧洲境内发动攻击。年初遭到攻击的法国「查理周刊」（Charlie Hebdo）就曾名列前10的攻击对象之一。
戴科乔夫表示，目前至少有5000名欧洲公民前往叙利亚或伊拉克，其中部分公民并未在各国的监测名单中。所以如果他是恐怖组织领导人，他宁可启用这些并未被监控丶仍拥有合法有效旅行文件的欧洲公民，在训练後将他们送回欧洲发动攻击，根本不需要从难民下手。